西藏藏醫藥大學是一所集學研醫產于一體的民族傳統醫藥高等院校，是教育部批準的全國唯一單獨設置的藏醫藥高等學校，是西藏自治區人民政府與國家中醫藥管理局共建大學，國家教育體制改革“藏醫藥人才培養模式改革試點”單位，是教育部構建傳統與現代相結合的藏醫藥現代高等教育體系與人才培養模式試驗區，是中醫藥管理局中醫藥重點學科單位和藏醫藥優勢學科繼續教育基地。

學校的前身為1989年9月經西藏自治區人民政府批準創建的西藏大學藏醫學院；1993年2月，國家教委批準西藏大學藏醫學院獨立設置為藥王山藏醫學院；2001年，更名為西藏藏醫學院；2018年12月，更名為西藏藏醫藥大學。