南通科技職業學院有環境與生物工程學院、園藝與景觀工程學院、機電與交通工程學院、信息與智能工程學院、工商管理學院、馬克思主義學院、繼續教育學院、國際教育學院、創新創業學院等學院，以下是具體名單一覽表，供大家參考，如有變動，以學校最新公布的信息為準。

1、學院設置

環境與生物工程學院

園藝與景觀工程學院

機電與交通工程學院

信息與智能工程學院

工商管理學院

馬克思主義學院

繼續教育學院

國際教育學院

創新創業學院

2、南通科技職業學院簡介

南通科技職業學院（Nantong Vocational College of Science & Technology）是一所由南通市人民政府舉辦，并經江蘇省人民政府批準設立的一所專科層次的全日制公辦普通高等院校。

南通科技職業學院始建于1945年，經歷過國立高級農業職業學校、南通農業專科學校、江蘇省南通農業學校等時期；2003年7月，經江蘇省人民政府批準，學校升格為南通農業職業技術學院；2014年10月，更名為南通科技職業學院。