徐州生物工程職業技術學院有農林工程學院、動物工程學院、藥品食品學院、信息管理學院、生物裝備學院、衛生健康學院、生態環境學院、新沂分院、馬克思主義學院、繼續教育學院等學院，以下是具體名單一覽表，供大家參考，如有變動，以學校最新公布的信息為準。

1、院系設置

農林工程學院

動物工程學院

藥品食品學院

信息管理學院

生物裝備學院

衛生健康學院

生態環境學院

新沂分院

馬克思主義學院

繼續教育學院

基礎部

體育部

2、徐州生物工程職業技術學院簡介

徐州生物工程職業技術學院（Xuzhou Polytechnic College of Bioengineering），簡稱“徐州生物工程職院”，前身是創建于1956年的江蘇省徐州農業學校。

2012年經江蘇省人民政府批準、教育部備案，升格為“徐州生物工程職業技術學院”，為公辦普通高等學校，是全省唯一的生物工程類職業技術學院、蘇北唯一的農業類普通高等院校。