安徽中醫藥高等專科學校有中醫學系、藥學系、康復保健系、護理系、口腔醫學系、臨床醫學系、基礎教學部、思政教研等院系，以下是具體名單一覽表，供大家參考，如有變動，以學校最新公布的信息為準。

1、院系設置

中醫學系

藥學系

康復保健系

護理系

口腔醫學系

臨床醫學系

基礎教學部

思政教研部

2、安徽中醫藥高等專科學校簡介

安徽中醫藥高等專科學校（AnHui College of Traditional Chinese Medicine）位于安徽省蕪湖市，是安徽省示范性高等職業院校。學校為教育部中醫藥職業教育教學指導委員會副主任委員單位、全國中醫藥職業技術教育學會常務副理事長單位、全國中醫藥高職高專教育教材建設指導委員會主任委員單位、安徽省中醫藥學會中醫養生保健專業委員會理事長單位、安徽省藥學會中藥材種植（養殖）專業委員會理事長單位。

學校始建于1960年，時名“蕪湖市中醫學校”；1999年，經安徽省人民政府批準，學校更名為“安徽省中醫藥學校”，2001年，學校獨立升格并于次年經教育部批準，在全國同類院校率先更名為“安徽中醫藥高等專科學校”，2010年，成功創建了“安徽省示范性高等職業院校”。