菏澤醫學專科學校有臨床醫學系、護理系、藥學與檢驗系、口腔醫學系、醫學技術系、健康管理系、中醫藥系等院系，以下是具體名單一覽表，供大家參考，如有變動，以學校最新公布的信息為準。

1、院系設置

臨床醫學系

護理系

藥學與檢驗系

基礎醫學部

思想政治理論教學部

口腔醫學系

醫學技術系

健康管理系

中醫藥系

公共教學部

2、菏澤醫學專科學校簡介

菏澤醫學專科學校（Heze Medical College）位于中國牡丹之都——山東省菏澤市，是一所由山東省人民政府舉辦的省屬公辦全日制普通高等專科學校。

菏澤醫學專科學校的前身是1950年經國務院批準建立的平原省衛生學校；1958年，更名為菏澤地區醫學專科學校，后又歷經山東省菏澤地區衛生學校、山東省菏澤地區醫學專科學校、山東省菏澤地區衛生學校等辦學時期；1978年經國務院批準，更名為菏澤醫學專科學校。