截至目前，制藥工程專業通過工程教育專業認證的高校有華東理工大學、合肥工業大學、大連理工大學、常州大學、昆明理工大學、四川大學、北京化工大學、浙江工業大學、南京工業大學、鄭州大學等，說明這些大學的制藥工程專業是比較強勢的，以下是具體名單一覽表，供大家參考。