亳州的大學排名第一的是亳州學院，排名第二的是亳州職業技術學院，以下是具體榜單，供大家參考。

1、亳州學院

亳州學院是國家教育部批準設置的公辦普通本科高校，坐落于“國家歷史文化名城”、全國“四大藥都”之首——安徽亳州。這里文脈悠長，人文薈萃，一批圣哲先賢誕生于此，具有3700多年歷史的亳州成為彪炳史冊、澤被中華的道家文化、中醫藥文化的發祥地。

學校辦學始于1909年創辦的蒙城師資講習所，1952年設置蒙城師范學校，2002年3月經國家教育部批準，獨立升格為亳州師范高等?？茖W校。2016年3月經國家教育部批準，獨立升格為亳州學院。

2、亳州職業技術學院

亳州職業技術學院（Bozhou Vocational and Technical College），坐落于安徽省亳州市，是全日制公辦普通高等職業院校，中華全國總工會“職工教育培訓示范點”、安徽省中藥天然藥專業委員會主任委員單位、安徽省中醫藥現代化研究會中藥分會會長單位、安徽省亳文化研究會研究基地。學院于2003年6月由安徽教育學院亳州教學點、合肥工業大學亳州教學點和亳州工業學校組建而成。