南方科技大學不是教育部直屬高校，南方科技大學是由廣東省主管的一所大學，位于廣東深圳，入選了雙一流大學建設高校。

1、教育部直屬高校簡介

教育部直屬高校指由教育部直屬管理的一批高等學校，是中央部門直屬高等學校的重要組成部分。

教育部直接管理一批高等院校，目的是在探索改革上先走一步，在提高教學、科研和社會服務等方面發揮示范作用。經過全國高校管理體制的調整，一批實力較強、學科特色鮮明的高校均劃歸教育部直屬管理。

在尚無教育部直屬高校的省份，教育部以部省合建形式重點支持河北大學、山西大學、內蒙古大學、南昌大學、鄭州大學、廣西大學、海南大學、貴州大學、云南大學、西藏大學、青海大學、寧夏大學、新疆大學、石河子大學等14所高校建設。

2、南方科技大學簡介

南方科技大學（Southern University of Science and Technology），簡稱“南科大”，位于廣東省深圳市，是國家“雙一流”建設高校、國家高等教育綜合改革試驗校、廣東省高水平理工科大學、廣東省高水平大學，入選深圳國際友好城市大學聯盟、深圳高校創新創業教育聯盟，是深圳市在中國高等教育改革發展的時代背景下、主要借鑒香港科技大學辦學經驗創建的一所公辦新型研究型大學。

2010年12月20日中華人民共和國教育部批準深圳市人民政府正式籌建南方科技大學，同年深圳市人民政府明確南方科技大學為深圳市人民政府直屬事業單位；2012年4月16日中華人民共和國教育部批準成立南方科技大學，明確其為廣東省人民政府管理、深圳市人民政府舉辦的公辦普通高等學校；2018年5月，南方科技大學獲批為博士學位授予單位。