黑龍江農業職業技術學院有農學系、建筑工程系、機電工程系、經濟管理系、信息工程系、動物科學系、食品藥品系等院系，以下是具體名單一覽表，供大家參考，如有變動，以學校最新公布的信息為準。

一、院系設置

農學系

建筑工程系

機電工程系

經濟管理系

信息工程系

動物科學系

食品藥品系

馬克思主義理論教研部

基礎部

軍事體育教學部

二、黑龍江農業職業技術學院簡介

黑龍江農業職業技術學院坐落在華夏東極、最佳生態環境魅力城佳木斯市，是黑龍江省東部地區唯一一所培養高等職業技術人才的全日制普通高等院校。

學院始建于1948年，其前身為聞名全國的黑龍江省佳木斯農業學校。2001年3月，經黑龍江省人民政府批準，晉升為黑龍江農業職業技術學院。2006年，在教育部高職高專院校人才培養工作水平評估中被評為優秀學校。2011年被黑龍江省教育廳確定為“黑龍江省骨干高等職業院校建設項目立項院校”。