福建體育職業技術學院有運動系、社會體育系、體育管理系、體育保健系、馬克思主義學院、海上運動學院等院系，以下是具體名單一覽表，供大家參考，如有變動，以學校最新公布的信息為準。

1、院系設置

運動系

社會體育系

體育管理系

體育保健系

馬克思主義學院

公共基礎課教育部

海上運動學院

2、福建體育職業技術學院簡介

福建體育職業技術學院是由福建省體育局舉辦，教育教學業務由福建省教育廳管理的一所省屬公辦體育高等職業院校。

福建體育職業技術學院成立于2005年，其前身是成立于1957年的福建省體育工作大隊。學校是全國體育職業教育教學指導委員會理論專業委員會主持單位、全國職業教育學校體育工作委員會副主席單位，并承擔全國體育職業教育教學指導委員會秘書處的日常工作；是福建省體育教練員、社會體育指導員、體育傳統項目學校體育師資等培訓基地和全國初級教練員崗位培訓考試考點，設有國家體育總局授牌的“運動員職業指導工作室”。