昌吉學院有馬克思主義學院、中國語言文學學院、外國語學院、經濟與管理學院、教育科學學院、數學與數據科學學院、物理與材料科學學院、化學與化工學院、能源與控制工程學院、信息工程學院等學院，以下是具體名單一覽表，供大家參考，如有變動，以學校最新公布的信息為準。

1、學院設置

馬克思主義學院

中國語言文學學院

外國語學院

經濟與管理學院

教育科學學院

數學與數據科學學院

物理與材料科學學院

化學與化工學院

能源與控制工程學院

信息工程學院

航空學院

體育與健康學院

音樂與舞蹈學院

美術與設計學院

2、昌吉學院簡介

昌吉學院（Changji University）坐落在新疆維吾爾自治區昌吉市，是區屬普通高等學校。學校前身是成立于1959年的昌吉師范學校，2001年5月升格為昌吉學院。

學校與山東大學、陜西師范大學、吉林大學、廈門大學、北京林業大學、蘭州大學、中國石油大學（華東）建立了長期對口支援關系，并與山東大學、陜西師范大學、廈門大學聯合培養本科生及研究生。