巴音郭楞的大學排名第一的是新疆科技學院，排名第二的是巴音郭楞職業技術學院，以下是具體榜單，供大家參考。

1、新疆科技學院

新疆科技學院，簡稱新科院，校區落戶美麗梨城——庫爾勒市。是由新疆維吾爾自治區人民政府領導和管理、經教育部批準設置的一所應用型本科層次普通高等學校，主要培養區域經濟社會發展所需要的高素質應用型、技術技能型人才。學校原為新疆財經大學商務學院，2019年12月26日，經教育部批準轉設為新疆科技學院。 奮進新時代，闊步新征程。新疆科技學院將堅持以新時代中國特色社會主義思想為指導，全面貫徹黨的教育方針，堅持社會主義辦學方向，以立德樹人為根本，貫徹新發展理念，融入新發展格局，立足建設高水平應用技術型大學定位，強化辦學優勢，彰顯辦學特色，推動內涵式高質量發展，辦好人民滿意大學，努力培養經濟社會發展所需要的高素質應用型人才。

2、巴音郭楞職業技術學院